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產品屬性:
產品名稱 | 英文名稱 | 規(guī)格 | 貨號 |
固定組織基因組DNA提取試劑盒 | FFPE DNA Extraction Kit | 50次 | CS-01F99063 |
本試劑盒適用于從福爾馬林固定、石蠟包埋的組織中有效純化總DNA,包括基因組DNA和線粒體DNA。本品使用專門優(yōu)化的裂解液和蛋白酶K,釋放福爾馬林固定或組織切片樣本中的DNA,無需過夜操作;消化后的樣品在較高的溫度孵育后,去除由福爾馬林交聯(lián)造成的抑制作用,有效提高DNA的產量和純度;優(yōu)化的緩沖系統(tǒng)使裂解液中的DNA可特異結合到硅膠吸附膜上,而其他污染物可流過膜;PCR和酶反應的抑制劑以及殘留的雜質可通過兩步漂洗步驟有效去除,最后使用低鹽緩沖液或水洗脫,即可獲得高純度DNA。經過純化的DNA可以直接用于PCR、Real-time PCR、SNP基因分型、STR基因分型和藥物基因組學研究等。
自備試劑:無水乙醇、10mM PBS(PH7.4)(固定液中的組織)。
實驗前準備及重要注意事項: 1、向蛋白酶K 中加入1.25ml 蛋白酶K 儲存液使其溶解,-20℃保存。配制好的蛋白酶K 勿長時間室溫放置,避免反復凍融,以免影響其活性。 2、獲得樣品后,要盡快將樣品在4%-10%的福爾馬林中固定,固定時間以14-24小時為宜,時間過長易導致基因組斷裂,影響下游實驗。 3、確保包埋前的樣品徹底脫水,殘留的福爾馬林會抑制蛋白酶K 的作用。 4、第一次使用前應按試劑瓶標簽說明先在Buffer GW1和Buffer GW2中加入無水乙醇。 5、使用前請檢查Buffer GTL和Buffer GL是否出現(xiàn)結晶或者沉淀,如有結晶或者沉淀,請將Buffer GL和Buffer GTL于56℃水浴重新溶解。 6、如果下游實驗對RNA污染比較敏感,可以在加入Buffer GL前加入4μl DNase-Free的RNase A(100 mg/ml),RNase A本試劑盒并未提供,如果需要可單獨向本公司訂購,貨號:WE0225S。 操作步驟: 1、樣本處理: a. 石蠟包埋樣本:用手術刀將組織塊中多余的石蠟修剪掉,露出組織。 b. 福爾馬林等固定液中的樣本:取約20 mg的樣本,切成小塊,置于離心管中,加入500μl 10mM PBS(PH7.4),渦旋振蕩,12000rpm(~~13400×g)離心1分鐘,重復3次,可直接進行第7步操作。 2、將組織塊切成5-10μM的薄片。 注意:如果樣品表面已經暴露在空氣中,請將接觸空氣的2-3片棄掉不用。 3、取約1×1cm2的切片(共約4-5片切片)置于離心管(自備)中,加入1ml二甲苯,蓋緊管蓋,渦旋震蕩10秒。 4、12000rpm離心2分鐘,小心吸棄上清,注意不要吸棄沉淀。 5、加入1ml無水乙醇,渦旋震蕩混勻。12000rpm離心2分鐘,棄上清,注意不要吸棄沉淀。 注意:乙醇可以除去樣品中殘余的二甲苯。 6、打開管蓋,室溫或最高至37℃孵育10分鐘,直至無乙醇殘留。 7、加入180μl Buffer GTL,重懸沉淀;加入20μl 蛋白酶K ,渦旋震蕩混勻。 8、56℃孵育1小時,直至樣品完全溶解。90℃孵育1小時。短暫離心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意: 1)此步驟的目的是修復由甲醛變性的核酸,孵育的溫度過高或時間過長可能造成DNA斷裂,產生DNA碎片。 2)56℃孵育后的樣品可置于室溫,直至水浴鍋或干浴鍋溫度達到90℃后再把樣品置于90℃孵育。 3)如需除去RNA,可將樣品溫度降到室溫后,加入4μl濃度為100 mg/ml 的RNase A溶液,震蕩混勻,室溫放置5-10分鐘。 9、加入200μl Buffer GL,渦旋震蕩徹底混勻。加入200μl無水乙醇,渦旋震蕩徹底混勻。短暫離心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意: 1)加入Buffer GL和無水乙醇后要立即充分混勻。 2)如果需要對多個樣品進行操作,可以將Buffer GL和無水乙醇事先混勻后加樣。 10、將步驟9所得溶液全部加入已裝入收集管的吸附柱中,若一次不能加完溶液,可分多次轉入。12000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 11、向吸附柱中加入500μl Buffer GW1(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 12、向吸附柱中加入500μl Buffer GW2(使用前檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 13、12000rpm離心2分鐘,倒掉收集管中廢液。將吸附柱置于室溫數(shù)分鐘以徹底晾干。 注意:這一步目的是將吸附柱中殘余乙醇去除,乙醇殘留會影響后續(xù)酶促反應(酶切、PCR等)。 14、將吸附柱置于一個新的離心管(自備)中,向吸附柱的中間部位懸空加入20-100μl Buffer GE或滅菌水,室溫放置2-5分鐘,12000rpm離心1分鐘,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。 注意: 1)如果下游實驗對pH值或EDTA敏感,可以用滅菌水洗脫。洗脫液的pH值對洗脫效率有很大影響,若用水做洗脫液應保證其pH值在7.0-8.5(可以用NaOH將水的pH值調到此范圍),pH值低于7.0時洗脫效率不高。 2)離心之前室溫孵育5分鐘可以增加產量。 3)用另外的20-100μl Buffer GE或滅菌水再次洗脫可以增加產量。 4)如果要提高DNA的終濃度,可以將步驟14所得的DNA洗脫液重新加至吸附膜上,重復步驟14;若洗脫體積小于100μl,可以增加DNA的終濃度,但可能會減少總產量。如果DNA的量小于1μg,推薦用20μl Buffer GE或滅菌水洗脫。 5)因為保存在水中的DNA會受到酸性水解作用的影響,如需長期保存,推薦用Buffer GE洗脫并于-20℃保存。儲存條件:室溫(15~30℃)。 |
原創(chuàng)作者:上海莼試生物技術有限公司
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