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本品是EB的水溶液，濃度為10mg/ml。EB(溴化乙錠)能與核酸分子特異結(jié)合，用于觀察瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠中DNA或RNA分子。廣泛應(yīng)用于核酸電泳前后的染色以及流式細(xì)胞儀的樣品染色處理等。溴化乙錠(Ethidium Bromide；C21H20N3Br；分子量為394.32)含有一個(gè)可以嵌入DNA 堿基的三環(huán)平面基團(tuán)。它與DNA 的結(jié)合沒(méi)有堿基序列特異性。大約每2.5 個(gè)堿基插入一個(gè)溴化乙錠分子。當(dāng)染料分子插入后，紫外激發(fā)后呈現(xiàn)熒光，可以檢測(cè)到10ng 的DNA 條帶。

使用方法：

使用前，先離心快甩EB溶液至管底，以防開(kāi)蓋后EB造成的污染。

瓊脂糖電泳凝膠的制備及染色(預(yù)染法)：

1. 按照所需濃度稱(chēng)取瓊脂糖，加入TAE或TBE緩沖液，在微波爐中加熱至徹底溶解。

2. 等凝膠溫度降至大約50-60℃以下時(shí)，加入10 mg/ml EB溶液至終濃度為0.5μg/ml (如100ml凝膠加入EB量為5μl)；徹底搖勻后鋪膠并插入梳子。

3. 凝固后，將梳子輕輕拔出。

4. 上樣電泳，電泳結(jié)束后紫外觀察。

瓊脂糖電泳凝膠的制備及染色(后染法)：

1. 按照所需濃度稱(chēng)取瓊脂糖，加入TAE或TBE緩沖液，在微波爐中加熱至徹底溶解。

2. 等凝膠溫度降至大約50-60℃以下時(shí)，不要加入EB溶液，直接鋪膠并插入梳子。

3. 凝固后，將梳子輕輕拔出。

4. 上樣電泳。

5. 電泳結(jié)束后將凝膠浸泡在含有EB的TAE或TBE染色液中(染色液配制：100ml 緩沖液中加入150-200μl EB溶液，混勻)染色15-20分鐘；TAE或TBE緩沖液中脫色10-15分鐘。

6. 紫外觀察結(jié)果。
儲(chǔ)存條件：室溫避光。

實(shí)驗(yàn)步驟：

(1)實(shí)驗(yàn)開(kāi)始前將RNA提取液于65℃水浴鍋中預(yù)熱,離心管中加入ME(巰基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)

(2)取約0.8g菌絲體(液體培養(yǎng)獲得的菌絲用真空抽濾即可！固體培養(yǎng)就更好說(shuō)了),在液氮中迅速磨成精細(xì)粉末,裝入50mL離心管,按1g材料8mL的量加入預(yù)熱的RNA提取液,顛倒混勻

(3)65℃水浴3-10 min,期間混勻2-3次

(4)加入等體積的酚(注意是酸酚pH4.5)::異戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(5)取上清,等體積的:異戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(6)加入1/4V體積10M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或過(guò)夜)

(7)10,000rpm,4℃離心20min

(8)棄上清,用500ul SSTE溶解沉淀

(9)酚::異戊醇(25:24:1)抽提兩次,:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)

(10)加2V體積的無(wú)水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上

(11)12,000rpm,4℃離心20 min

(12)棄上清.沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥

(13)加200ul的DEPC處理水溶解

(14)用非變性瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)掃描檢測(cè)RNA的質(zhì)量

(在抽提過(guò)程中,若蛋白質(zhì)含量或其它的雜質(zhì)還較多,可以增加抽提次數(shù))

操作步驟:

1. 勻漿處理:a.組織將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml TRIzol,用勻漿儀進(jìn)行勻漿處理。樣品體積不應(yīng)超過(guò)TRIzol體積10℅。

b.單層培養(yǎng)細(xì)胞直接在培養(yǎng)板中加入TRIzol裂解細(xì)胞，每10cm2面積(即3.5cm直徑的培養(yǎng)板)加1ml，用移液器吸打幾次。TRIzol的用量應(yīng)根據(jù)培養(yǎng)板面積而定，不取決于細(xì)胞數(shù)。TRIzol加量不足可能導(dǎo)致提取的RNA有DNA污染。

c．細(xì)胞懸液離心收集細(xì)胞，每5-10×106動(dòng)物、植物、酵母細(xì)胞或1×107細(xì)菌細(xì)胞加入1ml TRIzol，反復(fù)吸打。加TRIzol之前不要洗滌細(xì)胞以免mRNA降解。一些酵母和細(xì)菌細(xì)胞需用勻漿儀處理。產(chǎn)品僅用于科研

2．將勻漿樣品在室溫（15-30℃）放置5分鐘，使核酸蛋白復(fù)合物完全分離。

3．可選步驟：如樣品中含有較多蛋白質(zhì)，脂肪，多糖或胞外物質(zhì)（肌肉，植物結(jié)節(jié)部分等）可于2-8℃10000×g離心10分鐘，取上清。離心得到的沉淀中包括細(xì)胞外膜，多糖，高分子量DNA，上清中含有RNA。處理脂肪組織時(shí)，上層有大量油脂應(yīng)去除。取澄清的勻漿液進(jìn)行下一步操作。

5. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml，劇烈振蕩15秒，室溫放置3分鐘。

6. 2-8℃10000×g離心15分鐘。樣品分為三層：底層為黃色有機(jī)相，上層為無(wú)色水相和一個(gè)中間層。RNA主要在水相中，水相體積約為所用TRIzol試劑的60℅。

7. 把水相轉(zhuǎn)移到新管中，如要分離DNA和蛋白質(zhì)可保留有機(jī)相，進(jìn)一步操作見(jiàn)后。用異丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0.5ml異丙醇，室溫放置10分鐘。

8. 2-8℃10000×g離心10分鐘，離心前看不出RNA沉淀，離心后在管側(cè)和管底出現(xiàn)膠狀沉淀。移去上清。

原創(chuàng)作者：上海莼試生物技術(shù)有限公司

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