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放線菌主要通過形成無性孢子的方式進行繁殖，也可借菌體分裂片段繁殖。放線菌長到一定階段，一部分氣生菌絲形成孢子絲，孢子絲成熟便分化形成許多孢子，稱為分生孢子。

酵母菌的生殖方式分無性繁殖和有性繁殖兩大類。

無性繁殖包括：芽殖，裂殖，芽裂。

有性繁殖方式：子囊孢子。

芽殖：這是酵母菌進行無性繁殖的主要方式。成熟的酵母菌細胞，先長出一個小芽，芽細胞長到一定程度，脫離母細胞繼續生長，而后形成新個體。有多邊出芽、兩端出芽、和三邊出芽。

裂殖：少數種類的酵母菌與細菌一樣，借細胞橫分裂而繁殖。

芽裂：母細胞總在一端出芽，并在芽基處形成隔膜，子細胞呈瓶狀。這種方式很少。

子囊孢子：在營養狀況不好時，一些可進行有性生殖的酵母會形成孢子（一般來說是四個），在條件適合時再萌發。一些酵母，如假絲酵母（或稱念珠菌，Candida）不能進行有性繁殖。

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