1,先選擇好探針,然后設計引物使其盡可能的靠近于探針。
2, 擴增子的長度應不超過400bp,理想的能在100-150bp內,擴增片斷約短,有效的擴增反應就越容易獲得。較短的擴增片斷也容易保證分析的一致性
3, 保持GC含量在20%和80%之間,GC富含區容易產生非特異反應,從而會導致擴增效率的降低,及在SG分析中非特異信號。
4, 為了保證效率和重復性,應避免重復的核苷酸序列,尤其是G(不能有4個連續的G)
5, 將引物和探針互相進行配對檢測,以避免二聚體和發卡結構的形成。
1,在設計引物之前設計探針
2,探針的Tm值應在68-70℃之間,如果是目測探針,則要仔細審查GC富含區。
3,探針的5’端要避免有鳥氨酸,5’G會有淬滅作用,即使被切割下來這種淬滅作用也還會存在
4,選擇C多于G的鏈作探針,G的含量多于C會降低反應效率,這時就應選擇配對的另一條鏈作為探針。
6, 探針應盡可能的短,不要超過30個bp。
7, 檢測探針的DNA折疊和二級結構。
全新的熱啟動DNA聚合酶-Hot Start Taq DNA聚合酶,可在PCR反應的過程中抑制非特異擴增,從而最大限度地減少非特異性擴增產物的產生,提高熒光定量PCR反應的特異性;
采用新型的熒光染料EvaGreen,與傳統熒光染料相比,對PCR反應抑制更小,而且熒光信號更強,檢測靈敏度更高;
含有UNG的試劑盒可以防止PCR產物污染體系,進而有效防止實驗過程中PCR產物的交叉污染;
TaqMan熒光定量PCR試劑盒提供了除引物、探針、模板外的所有實驗所需組分,并配備2×Buffer,可完成不同類型熒光探針的實時熒光定量PCR反應,方便用戶使用;
原創作者:上海莼試生物技術有限公司